2000－2004年是我國農(nóng)業(yè)機(jī)械科技的完全市場化階段。在這一階段，一批研究所改組、改制或轉(zhuǎn)制為科研型企業(yè)；建立了一批企業(yè)技術(shù)中心，成立了國家農(nóng)業(yè)機(jī)械工程技術(shù)研究中心，以及教育部、農(nóng)業(yè)部等部屬重點實驗室；加強(qiáng)了技術(shù)創(chuàng)新、加速了高技術(shù)成本轉(zhuǎn)化，形成了有利于農(nóng)機(jī)科研成果轉(zhuǎn)化和產(chǎn)業(yè)化的機(jī)制；重點開展了適應(yīng)農(nóng)業(yè)和農(nóng)村經(jīng)濟(jì)發(fā)展新要求的、以解決農(nóng)業(yè)結(jié)構(gòu)戰(zhàn)略性調(diào)整和農(nóng)民增收急需的農(nóng)業(yè)機(jī)械技術(shù)研究開發(fā)，農(nóng)業(yè)裝備技術(shù)由單純注重勞動代替向保護(hù)環(huán)境和提高資源利用率并重方向發(fā)展。

我國旱作面積大，水土流失嚴(yán)重、土壤沙漠化擴(kuò)大，尤其是西北地區(qū)，發(fā)展保護(hù)性耕作更為重要。為此，農(nóng)業(yè)部在2002年啟動了“保護(hù)性耕作示范工程”項目。保護(hù)性耕作以深松技術(shù)、秸稈和跟茬處理技術(shù)、免耕播種技術(shù)為核心，在中國農(nóng)業(yè)大學(xué)高煥文等專家的共同努力下，這些技術(shù)都取得了豐碩的成果。

這一時期，我國發(fā)展了全方位深松、間隔深松、全層深松、淺翻深松、振動深松等多種深松技術(shù)。作業(yè)機(jī)具以中國農(nóng)業(yè)機(jī)械化科學(xué)研究院耕作種植機(jī)械研究所的深松整地聯(lián)合作業(yè)機(jī)、黑河市愛華農(nóng)機(jī)研究制造有限公司的深松聯(lián)合旋耕機(jī)、黑龍江勃農(nóng)機(jī)械有限公司的全方位深松機(jī)、現(xiàn)代農(nóng)裝科技股份有限公司的多功能振動式深松機(jī)為代表。

以錘爪和甩刀為主要部件的秸稈粉碎還田機(jī)，在北方旱作地區(qū)普遍推廣使用，產(chǎn)品向?qū)挿吐?lián)合作業(yè)方向發(fā)展。機(jī)械生產(chǎn)以河北企業(yè)為代表，包括河北農(nóng)哈哈機(jī)械有限公司、石家莊農(nóng)業(yè)機(jī)械股份有限公司等。

保護(hù)性耕作中的免耕播種技術(shù)，采用銳角式開溝器的小型免耕播種機(jī)，在未耕留茬地進(jìn)行免耕播種；采用機(jī)械或氣力式精量排種器和附加裝置的中耕作物免耕播種，在有留茬地或秸稈粉碎覆蓋地上免耕播種。中國農(nóng)業(yè)機(jī)械化科學(xué)研究院耕作種植機(jī)械研究所的精少量施肥免耕播種機(jī)和氣力式玉米免耕施肥精密播種機(jī)立下了汗馬功勞。

農(nóng)機(jī)科研的市場化階段，也是我國80－120馬力拖拉機(jī)技術(shù)日臻成熟的階段。大輪拖動力強(qiáng)勁、性能卓越、造型美觀，可配套犁、耙等機(jī)具進(jìn)行各種農(nóng)田作業(yè)，并可用于運(yùn)輸?shù)绕渌鳂I(yè)。電控系統(tǒng)由簡單的液壓懸掛系統(tǒng)電液控制向發(fā)動機(jī)控制、動力換擋、前驅(qū)動橋控制等集成控制發(fā)展；轉(zhuǎn)動系由純機(jī)械技術(shù)向機(jī)電液一體化技術(shù)轉(zhuǎn)變。

中國一拖、福田雷沃重工等占據(jù)了80－120馬力拖拉機(jī)銷售主力軍的位置。據(jù)統(tǒng)計，我國僅在2004年一年就銷售80－120馬力拖拉機(jī)接近2萬臺，同比近乎翻了一番。

與拖拉機(jī)關(guān)系**為緊密的是柴油機(jī)，在這一時期，我國農(nóng)用柴油機(jī)可以生產(chǎn)缸徑大于100毫米的中缸徑和大于160毫米的大缸徑系列產(chǎn)品；直噴技術(shù)、增壓技術(shù)普遍應(yīng)用，高壓共軌技術(shù)研制成功，節(jié)油減排技術(shù)發(fā)展，揚(yáng)柴、濰柴是其代表。

據(jù)不完全統(tǒng)計，2004年我國規(guī)模以上稻米、面粉、油料、棉花、茶葉、果蔬、淀粉等七類農(nóng)產(chǎn)品加工機(jī)械制造業(yè)，為國民經(jīng)濟(jì)創(chuàng)造了3907億元的農(nóng)產(chǎn)品加工工業(yè)產(chǎn)值，占當(dāng)年農(nóng)業(yè)總產(chǎn)值的10.8%。

光電技術(shù)中的代表性設(shè)備是農(nóng)產(chǎn)品色選設(shè)備，它利用光電原理，從某種大量散裝的農(nóng)產(chǎn)品中將顏色不正常的或感受病蟲害的顆粒以及外來雜物識別出來并進(jìn)行分離。合肥萬興機(jī)械有限公司、石家莊三立谷物精選機(jī)械有限公司的色選機(jī)在這一時期比較暢銷。

農(nóng)產(chǎn)品加工自動控制技術(shù)通過自動檢測、信息處理和分析判斷等手段，使農(nóng)產(chǎn)品加工機(jī)械和相關(guān)系統(tǒng)自動地實現(xiàn)預(yù)期操作，從而代替人完成某種生產(chǎn)任務(wù)、生產(chǎn)過程或事物管理等工作。中國包裝和食品機(jī)械總公司的無菌包裝機(jī)“一家獨(dú)大”。

輻射殺菌技術(shù)采用電子束、γ射線等對農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)行輻照，通過激化農(nóng)產(chǎn)品中所含的水分及其他分子，使活體生物的生命受損或中斷，有效地殺滅食源性致病菌等微生物和傳染性寄生蟲，從而達(dá)到對農(nóng)產(chǎn)品滅菌保鮮、提高衛(wèi)生質(zhì)量等目的。（信息來源2008年12月10日  中國農(nóng)機(jī)化導(dǎo)報）